לפני 23 שנים הוקמה הישיבה הגבוהה באיתמר על ידי הרב אביחי רונצקי זצ"ל, ובראשית ימיה מנתה עשרה תלמידים. בחלוף הימים, הלכו ורבו התלמידים, וכיום לומדים בבית המדרש 150 תלמידים ו25 אברכים. כיום משמש הרב יהושע ון דייק ראש הישיבה.
הקו המנחה את הלימוד בישיבה הוא קו של חיבור וריבוי אהבה – לתורה, לעם ולארץ. בישיבה שורה אווירה משפחתית חמה וביתית, התלמידים נרתמים לעשייה משותפת למען הישיבה, ואלו יוצרים תחושה חזקה של אחווה, רעות ודיבוק חברים.
הישיבת באיתמר הינה בעלת גישה מיוחדת המכילה ומקבלת מגוון של דעות. בסבלנות ובמסירות מעניקה הישיבה יחס אישי וחם לכל, ופועלת על פי הפסוק: "חנוך לנער על פי דרכו".
יש מסלול ישיבה גבוהה ויש מסלול הסדר. רובם מתגייסים לאחר שנתיים וישנה קבוצה קטנה שנשארת לעוד שנה. רוב התלמידים מתגייסים לשירותי צבאי משמעותי בסיירות המובחרות ויוצאים לרוב לפיקוד.
ישנו רב שאחראי על ביקור בבסיסים מידי שבוע. כמו כן, שומרים על קשר אישי טלפוני. והרבה מן החיילים מגיעים בחופשות ושבתות לישיבה. "את איתמר לא עוזבים אלא רק באים פחות.."
הרב יהושע ון דייק, ת"ח גדול, רב שמחובר לחיים. כבר 18 שנה משרת בקודש את רקהילה רמת מגשימים בגולן. הדבר המיוחד אצל הרבנים אצלינו- שהם באים בגובה העיניים, הכל בכיףך ובשמחה, בלי הרגשת דיסטאנס.